恩克鲁玛却自命不凡，自封“加纳国父”，大搞个人迷信，到处为自己建造精致的纪念碑，肆意挥霍政府正在迅速减少的资金。不仅如此，他还自命是“非洲的独立之父”，联合其他非洲国家于1963年组建“非洲统一组织”。该组织总部设在埃塞俄比亚，恩克鲁玛为建设总部耗费了加纳大量资金，此外他还把加纳有限的钱财，源源不断地倾注在非洲其他地方的独立运动上，导致国内财政形势相当严峻。
进入60年代，加纳主要出口物品可可价格暴跌，加纳再也没有任何储备可以依靠了。当经济情况恶化时，恩克鲁玛显得束手无策，企图通过合并几内亚来度过危机，结果宣告失败。随着经济形势不断恶化，加纳国内局势开始动荡，反对恩克鲁玛的声音日益高涨。为了打击反对势力，恩克鲁玛逐渐走向独裁。1964年，他宣布实行取消议会多党制，自己出任“终身总统”，许多抨击思克鲁玛的人被投入监狱。
恩克鲁玛以为高压之下，他的统治能够稳固下来，结果国内形势更加动荡。1966年2月24日，当恩克鲁玛外出访问之际，军方发动政变推翻了他的政权。此后，恩克鲁玛再也未能回到祖国加纳。1972年，恩克鲁玛病逝于罗马尼亚布加勒斯特，享年63岁。在他死后，鉴于曾经在独立运动所作杰出贡献，加纳当局同意遗体运回家乡安葬。20年后，他的遗骨又被移至首都陵园安葬，供世人瞻仰。
