针对国内腐败问题严重，丹瑞发动了多次大规模反腐运动。2002年，前领导人吴奈温女婿和三个外孙因贪腐被捕，经过审讯，最后以“涉嫌阴谋发动政变罪”判处死刑。受此事牵连，大批军队将领受到追究，吴奈温和他的女儿也被软禁在家中，国内官场为之整肃。一年后，丹瑞宣布不再兼任总理职务，并起用钦纽上将出任总理，但实际仍然控制国家最高权力。钦纽的工作没有得到丹瑞的认可，一年后被突然解职，由梭温中将接任。
不久，梭温又被丹瑞心腹吴登盛将军取代。在此期间，丹瑞大将曾有过短暂轻度中风，虽经治疗后身体渐渐康复，但他所领导的国家面临内忧外患，却不是短期内能消除的。缅甸本来经济落后，在西方长期制裁和封锁下更是雪上加霜，经济逐步陷入困境，也使缅甸在国际社会上日益孤立。为改变困境，丹瑞决定实行政治改革，希望通过放松国内控制，来说服国际社会取消对缅甸制裁。
丹瑞采取了一系列民主改革措施，诸如释放反对派领袖，开放言论自由等。最大的亮点是，2008年缅甸通过了新的宪法，将首都从仰光迁到内比都，并将实行总统制。经过激烈的总统大选，2011年2月，吴登盛当选为缅甸首任总统。这些革命性措施引起了国际社会广泛关注，从而也改变了对丹瑞将军负面评价。当年4月4日，“年仅仗朝”、78岁的丹瑞宣布从军方高层职位退下，正式结束了他19年的执政生涯。
