由于这些破旧书页毫无价值，当时负责看管的政府官员对这批文物并不在意，导致经常有人偷拿这些被装在麻袋当中的古籍。
后来博物馆甚至以经费不足为由，将这批8000麻袋的巨量档案，以4000元的价值卖给了一家纸店。
这件事被罗振玉直到之后，他立刻用尽自己的全部家当，以三倍的价值买回了一批旧档，但由于财力有限，剩余大量的文献仍旧有被损坏的危险。于是他四处奔走找人借钱，但遗憾的是，这篇批档案仍旧损失了两万多件，让人痛心无比。
1924年，散尽家财的罗振玉，再也无力来保管这批珍贵的资料，于是他便将这批文档卖给了好友李盛铎。而这位李盛铎在几年之后，又将这批文献卖给了中央研究院。
