自 2016 年开始，吴新锋组织主办了三届"中国神话与西王母文化研究学术研讨会"，成为国内神话学研究、昆仑文化研究、西王母神话研究的重要学术交流平台；2017年，主持首届新疆民间文化高级研修班（唐仲英基金会特别支持）；组织第十四届全国民间文化青年论坛。
吴新锋主持国家社科基金2项（《多元文化交流视野下的新疆世居民族民间文学研究》《海峡两岸西王母神话信仰研究》），主持兵团社科基金重大项目1项（《面向文化润疆的中华文化符号和中华民族视觉形象系统建构与实践路径研究》），主持中国科协国家级课题1项；主持自治区党委涉疆重大选题项目《中华昆仑文化研究》，并主持校级项目和横向项目多项。
