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根据台湾水利工程学者李鸿源的说法，现任内政部门负责人刘世芳是在两周前打电话给他，评估堰塞湖如果溢流会影响的范围以及如何疏散。台大防灾团队在9月21日评估溢淹影响范围将比先前预估更严重，最终让执政当局在当天决定匡列撤离8000人。
依台农业部门新闻稿，农业部门9月19日举行堰塞湖专家小组第二次会议与"因应桦加沙台风来袭本部整备会议"，当天虽评估马太鞍溪堰塞湖可能在台风期间发生溢流，但在匡列撤离人数部分，农业部门次长黄昭钦说，"即时启动疏散避难措施，保障该区690余位保全对象生命安全。"
在此之前，农业部门、"林保署"专家，以及花莲县政府所获知的资讯，都是认定发生溢流时的撤离匡列人数为690人；"林保署"在9月20日12时、9月21日11时发出的撤离紧急通报单，匡列范围为人数为690人。
然而在9月22日上午7时的通报单中，不到一天，匡列人数从600多人变成8000多人。可以说台大团体进场太迟，"林保署"提供的资料有误，是让花莲基层人员大喊吃不消的根源。
灾后景象。（台媒）
22日下午， 台"中央"灾变中心在会议中重申：本次撤离计划应以最高标准规划，请花莲县政府确实执行，并希望考量民众自身安全配合撤离，其中垂直避难部分应注意是否仅积淹水之危害或夹杂土石，不同灾情以不同方式应对；依亲者应确认确实撤离至安全处所；并注意安置中心环境卫生及物资供应妥善预布。
花莲县府事后指出，红色警戒发布后，县府与地方乡镇公所已开始进行强制撤离。但花莲县府也说明撤离行动艰难的原因，由于依据台大专家最新模拟结果，内政部门前一天将警戒范围扩大7倍，警戒区的户数也从 245 户扩大到 1800余户，县府撤离作业只能"全力与时间赛跑"。
光复乡乡长林清水受访时曾说明，这次撤离人数众多，避难收治量能不足，因此经协调后，乡亲可采依亲、垂直撤离或到收容所暂时安置三种方式，例如住宅是二楼以上建物，乡亲可以准备饮食及物资，建议采垂直撤离方式暂居二楼，以备溃堤随时发生。
