第一个缺点，耗能离谱。
蒸汽弹射系统对航母的动力系统要求极高，能量利用效率仅有4%-6%，大部分能量被浪费了。
而福特号电磁弹射系统的能量利用率达到了60%，中国福建舰的电磁弹射系统能量利用率更是高达90%。
能量利用率高，就可以把能量节约下来做其他的事情。
但这个还只是蒸汽弹射系统所有缺点里最小的那一个。
第二个缺点，启动太慢。
完全的冷启动，电磁弹射系统只需要18分钟，而尼米兹级航母的蒸汽弹射系统，冷启动的常态战斗数据为45~90分钟。
需要蒸汽储存和管线预热的特点，让蒸汽弹射系统的准备时间特别长，如果是有了充分准备时间的进攻那还好，如果是被突然袭击需要紧急升空，那这个时间差距有可能是致命的。
第三个缺点，体积巨大。
蒸汽弹射系统重达500~530吨，占用空间1100-1132立方米，而电磁弹射系统重约200多吨，占用空间425-500立方米。
而且这些仅是主机差距，蒸汽弹射还额外需要大量的蒸汽管道、高压储气罐和大量的淡水消耗，如果把这些占用的空间都算上，那差距更加夸张。
采用电磁弹射系统后，节省下来的宝贵空间和重量，可以用来搭载更多航空燃料、弹药或其他装备，直接提升航母的持续作战能力，同时系统维护更简单，模块化的电气系统需要的维护人员更少。
第四个缺点，蒸汽弹射的推力调节幅度小。
电磁弹射系统可以轻易调节推力大小，上到三四十吨的重型舰载机，下到两三吨的无人机，电磁弹射系统都支持弹射，但蒸汽弹射系统调节起来就麻烦多了，毕竟调节蒸汽比调节电流要困难的多。
这就导致能上蒸汽弹射航母的仅有提前设定好的机型，想后期增加很困难，适用幅度窄。
第五个缺点，对环境要求高。
蒸汽弹射系统是热推动，对环境的温度是有要求的，在寒冷海域效率会明显降低，甚至可能因为蒸汽冷凝结冰而影响整个航母的使用。
而电磁弹射则完全没有这种顾虑，在所有环境下表现都差不多，而且作为船体综合电力系统的一部分，和未来定向能武器的兼容性更好，为航母未来的升级改造奠定了基础。
第六个缺点，也是最大的那个，能量恢复速度慢。
电磁弹射系统的超级电容，充能一次仅需15秒，而蒸汽弹射系统的锅炉蒸汽充能，最快也要45~90秒，而且在连续弹射8-10次后需暂停15-20分钟恢复压力。
这直接导致电磁弹射航母可以多机连续弹射，方式是交替使用弹射器无需停顿（如1-2-3-4循环），而蒸汽弹射航母在压力不足的时需要暂停1~2条弹射器。
加上甲板复位、飞机定位、油料补给等消耗的时间。
所以美国的蒸汽弹射航母，一昼夜极限只能出动150架次，而福特号的设计标准是一昼夜270架次，实际测试做到了300架次。
