"飓风-3000"既可独立作战，也可与激光、弹炮武器等多车组网作战，组成末端反无人机作战的"铁三角"。其作战流程为：先由雷达完成目标探测，再交由光电设备实现精准跟踪锁定，然后发射高功率微波对目标进行毁伤。
与电子干扰类反制手段不同，微波武器属于"硬杀伤"武器范畴，能够直接对无人机的电子元件造成物理损毁。研制方特别强调该系统的三大优势：单次发射成本极低、"弹药"近乎无限、附带损伤微乎其微。相较于逐一对抗目标的激光武器，微波武器系统具备大范围覆盖能力，因此在应对无人机集群饱和攻击时，优势尤为显著。
"飓风-3000"与导弹、激光反无人机武器共同构成了中国多层级反无人机防空体系。
