有观点认为，除非她选择拉拢右翼的日本维新会或国民民主党加入执政联盟，否则连预算案的通过都会变得极为困难。
更加严峻的是，由自民党与公明党组成的执政联盟已经失去了众参两院的半数席位，陷入到了"少数执政"困境。
无论谁担任首相，都要必须与立宪民主党、日本维新会、国民民主党等在野党进行政策协调，而这正是她的弱项。
2025年8月1日，日本东京，国会议事堂
第四，她难以应对日本外交的复杂局面。
在当前国际形势快速变化的背景下，如何定位自身、营造有利的外部环境，是每一位日本领导人必须面对的挑战。
从高市早苗的一贯主张看，她既表现出了较强的反美倾向，主张减少对美依赖，又是强硬的对华鹰派。
比如她曾公然声称，若自己当选首相，会参拜靖国神社；在今年4月，更是与自民党众议员黄川田仁志、参议员佐藤启等六人窜访台湾，不仅极力为"台独"势力撑腰，甚至扬言"台海有事时，日本应不惜与中国热战"。
以上言行，势必加剧中日紧张关系。
高市早苗在赢得自民党总裁选举后的庆祝
第五，尽管高市早苗是自民党总裁，但即便在党内，根本不可能随心所欲地"想干啥就干啥"。
