巴尔博亚港是巴拿马运河集装箱运输量第二大港口，位于太平洋巴拿马湾一侧运河入口处，拥有5个集装箱船码头，去年集装箱装卸数量预计超过260万个。该港口与巴拿马第五大港口克里斯托瓦尔港一样，此前由长江和记实业有限公司（长和）运营，但长和3月4日宣布，拟向美国贝莱德牵头的BlackRock-TiL财团出售旗下子公司和记港口在巴拿马港口公司90%的股权。克里斯托瓦尔港位于巴拿马运河的大西洋出口处，拥有3个集装箱码头，去年装卸111万个标装箱。
巴拿马运河第三大港口为科隆港，位于科隆省运河大西洋入口处，也建在前美国军事基地上，拥有4个集装箱码头，由中国台湾长荣集团运营。2024年，该港口装卸超过150万个标准集装箱。罗德曼港是巴拿马运河的第四大港口，位于巴拿马城西南方向、太平洋一侧运河入口，由新加坡港务集团旗下的PSA巴拿马国际码头公司运营，2024年的集装箱吞吐量超过130万个标准箱。 3.8万美国人为修运河而死？
特朗普一直声称，美国为修建巴拿马运河"付出了巨大的生命和财富代价"，运河后被"愚蠢地"交给巴拿马管理，美国对巴拿马"极为慷慨"，但却被巴拿马"不公平对待"，需要向巴拿马缴纳高昂的运河通行费。特朗普的上述言论引发巴拿马政府及学界的驳斥和狠批，就连包括美国在内的一些西方媒体和学者也纷纷发文，讲述真实的历史。比如，特朗普声称"3.8万名美国人为修建运河而牺牲"。巴拿马新闻社直言，这是伪造的信息。在运河开凿期间，共有5609人因疾病和事故丧生，但他们绝大多数都不是美国人。
英国《卫报》2016年就报道称，这些死者中只有350人是白人，其余是巴拿马本地人和来自加勒比海地区的移民。巴拿马为运河的开凿付出了沉重代价。美国要求巴拿马在运河开凿路线两侧各让出5英里（1英里约合1.6公里）的土地，在这些土地上建立了巴拿马运河区，华盛顿在这一区域行使事实上的主权并实施了类似种族隔离的制度。运河区内由美国政府任命总督，升美国国旗，实行美国法律，驻扎美国军队，是名副其实的"国中之国"。运河区外的巴拿马民众在进入该区域时甚至可能遭到阻拦。
《地峡边境：种族、文化与运河区之争》一书的作者、美国人多诺霍说："巴拿马居民有时连穿越自己的国家都要面对外国警察。"到20世纪50年代，因为紧张局势加剧，巴拿马当局同意在巴拿马城和运河区之间修建一堵墙。特朗普认为，开凿巴拿马运河是美巴合作的象征，美国"宽宏大量地将运河交给巴拿马"。对此，巴拿马新闻社批驳说，这并不是华盛顿善意的体现，而是一种历史正义行为，是对巴拿马在国际条约支持下的主权的承认。
