6月20日，中国外交部发言人林剑曾重申，仁爱礁是中国南沙群岛的一部分，是中国领土。6月17日，菲律宾未经中方允许非法侵闯仁爱礁海域，违反国际法，违背《南海各方行为宣言》精神，纯属无理挑衅。
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"更何况，菲方此次行动根本不是什么人道主义物资补给。菲方船只不仅夹带建筑材料，还偷运武器装备，故意冲撞中方船只，菲人员还对中方执法人员泼水、投掷物品等，有关做法明显加剧海上紧张局势、严重威胁中方人员和船只安全。中方依法采取必要措施维护自身主权合法合理，专业克制，无可非议。"林剑强调："中方将坚决维护自身合法权益，同时敦促菲方立即停止海上侵权挑衅，否则后果自负。"
据外交部网站消息，7月2日，外交部副部长陈晓东同菲律宾外交部副部长拉扎罗在马尼拉共同主持召开中菲南海问题双边磋商机制（BCM）第九次会议。
双方就南海形势特别是管控仁爱礁局势坦诚、建设性地交换了意见。中方重申对包括仁爱礁在内的南沙群岛及其附近海域拥有主权，对相关海域拥有主权权利和管辖权，敦促菲方立即停止海上侵权挑衅行径，切实遵守《南海各方行为宣言》各项规定，回到通过对话协商妥处分歧的正轨，同中方共同管控好仁爱礁局势，推动海上局势趋缓降温，推动中菲关系止跌企稳。
