首款!中国地方鸡专用芯片"神农1号"研发成功!
3月16日,我校康相涛教授团队基于前期鸡泛基因组研究成果与公共数据,开发了适用于我国地方鸡基因组系列液相芯片--"神农1号"。该系列芯片的成功研发,搭建了用于地方鸡种质资源鉴定、精准评价、保护与开发利用的高效技术平台,对我国家禽种业振兴与可持续发展具有重要的意义。
58个地方鸡品种地理分布
该系列芯片采用模块组合的设计思路:模块I是利用66.5M泛基因组序列,设计5K标记;模块II是整合生长、繁殖、屠体等性状GWAS的功能位点,设计5K标记;模块III是整合我国58个地方鸡种中高频SNP位点,设计30K标记;模块IV是整合生长、羽色等性状的原因InDel、SV、PAV突变位点。集成上述模块,创制了40K、5K地方鸡基因组系列芯片--"神农1号"。
"神农1号"40K地方鸡基因组芯片位点分布