除去《收费公路管理条例》的修订另一个重要的时间节点可以追溯至2009年2月，国务院办公厅当时转发了国家发改委、交通运输部和财政部制定的"逐步有序取消政府还贷二级公路收费实施方案"（下称"实施方案"），对于东、中、西部地区停止审批新的收费二级公路项目，以及取消已有政府还贷二级公路收费都给出明确时间表。
随着《收费公路管理条例》于2004年施行，东部地区已于当年停止发展二级收费公路。实施方案要求，中部地区从2009年起，停止审批新的二级收费公路项目。西部地区的省份如决定取消政府还贷二级公路收费，从决定取消之日起，同步停止审批新的二级收费公路项目。此外，对于存量收费二级公路，从2009年起到2012年年底前，东、中部地区逐步取消政府还贷二级公路收费，使全国政府还贷二级收费公路里程和收费站点总量减少约60％。西部地区是否取消政府还贷二级公路收费，由省级政府自主决定。
就在2009年2月底与4月底两个时间节点，先后有第一批5个省份与第二批7个省份，共计12个中东部省份停止政府还贷二级公路收费，占全国政府还贷二级公路收费站总量的65％。
2016年9月，国务院办公厅印发了《关于转发国家发展改革委物流业降本增效专项行动方案（2016-2018年）的通知》，要求交通运输部、国家发展改革委、财政部按职责分工负责，持续推进"逐步有序取消政府还贷二级公路收费"。
一些西部省份取消收费二级公路则经历了更为漫长的过程，如甘肃直到2017年年底前才一次性取消全省政府还贷二级公路收费。
在当时收费公路总里程中，收费二级公路里程和收费站均占收费公路总量的60％左右，但是随着高速公路建设逐渐形成网络，原有的二级公路的干线骨架作用功能逐渐削弱，加之二级公路收费站大多分布在城乡居民频繁使用的区域，因此收费二级公路成为第一批被取消的收费公路。
尽管实施方案仅涉及二级公路，但是一些省份会将收费的一级公路同步取消。如2017年4月，宁夏比原计划提前半年多撤销全区25个政府还贷普通公路收费站，涉及一级公路、二级公路、独立的大型桥梁和隧道。
在实施方案推出后，时任交通部新闻发言人特别强调，将加强一级收费公路管理，特别是严格控制和规范将取消收费后的政府还贷二级公路改建升级为一级公路继续收费，从而建立以高速公路为主体的、低收费、高效率的收费公路网络和以普通公路为主体的非收费公路网络。
这也是人们习惯将高速公路与收费公路相对应，国道、省道等普通公路与非收费公路概念对应的由来，这也确实是2009年以来的趋势。
取消收费后，新建公路如何筹资？
"贷款修路、收费还贷"政策，最早是因政府财政资金不足而兴起，在取消收费公路时也势必面临两个问题，存量收费公路如何还贷？后续新建公路如何筹资？
"贷款修路、收费还贷"模式，曾对中国公路网的快速发展起到过积极作用。截至2009年年中，在国内公路网络中，95％的高速公路，61％的一级公路，42％的二级公路依靠收费公路政策建设。据时任交通运输部新闻发言人何建中介绍，如果没有收费公路政策，我国二级以上高等级公路将比现在减少三分之二以上规模。
当时之所以没有对西部地区取消政府还贷二级公路定下收费时间表，主要是由于区位、财力等原因，西部地区当时还难以进行大规模的高速公路建设，二级公路仍是区域干线公路建设发展的主要重点。如果取消收费二级公路，干线公路建设的筹资将会遇到很多困难，这也是当年实施方案提出"逐步有序取消"的原因。
其实，2009年"实施方案"发布的一个重要契机便是2008年年底，国务院印发了《关于实施成品油价格和税费改革的通知》，逐步有序取消政府还贷二级公路收费是其中的重要组成部分。
当时确定中央每年从成品油消费税中安排260亿元专项资金，补助各地取消政府还贷二级公路收费，用途包括债务偿还、人员安置、养护管理和公路建设等。普通公路投资的体制逐步被理顺。
何建中在2009年曾表示，在今后一段时期内，收费公路政策仍将是我国筹集公路基础设施建设资金不可或缺的政策渠道。但是，随着国家财力的不断增强和公路网络的逐步完善，各级地方政府要不断加大财政资金的投入力度，逐步提高政府预算内资金在公路建设和养护费用中的比重，发挥政府在公路建设和发展中的主导作用，承担政府应有的公共财政义务。
换言之，以2008年成品油价格和消费税改革为契机，相对于高速公路，普通公路的公益性逐步强化。
不过，现行政策依然为以"贷款修路、收费还贷"的方式建设一级公路，乃至为西部省份的二级公路收费留下"口子"。
"普通公路并未被严格定义为一种政府提供的公共产品，因此资金来源仍然多元，是否收费也取决于此，如果资金来源于公共预算收入，自然不会收费，但如果来自银行贷款，或是通过PPP模式引入社会资本，则需要收费还债。不过从过往PPP入库项目来看，更多是高速公路项目，鲜有普通公路项目。"中央财经大学教授温来成告诉《中国新闻周刊》，一方面是由于普通公路网络已经日益完善，另一方面则由于高速公路能获得稳定收益。
在政策留有空间的情况下，地方财力成为决定修路资金来源的关键。
2012年4月发布的《江苏交通"十二五"发展规划纲要》曾提出，对部分政府财力不足的苏北地区适当发展一级收费公路项目，加紧普通公路调整布局，指导普通收费公路持续健康发展。此次引发关注的宿淮收费站正位于苏北。
是否继续收费，往往也影响到当地的营商环境，不少司机和当地市民也普遍呼吁尽早取消普通公路收费。
以312国道陕西咸阳至永寿一级公路收费站为例，早在2018年，当地媒体曾接到咸阳市双照街办和乾县的一些村民反映，称312国道咸阳至永寿段上的双照和乾县两座收费站已经设立20年了，不仅增加了沿线群众出行负担，更阻碍了地方经济的发展，希望政府能够从民生和招商引资方面考虑，撤销这两座收费站。
"为了节省过路费，许多车辆都选择从收费站两侧的村子绕行。" 当地村民认为，咸永一级公路这两座收费站从1998年元月份开始收费，到2018年已经接近20年。2012年，政府已经取消了312国道上的永寿、彬县、长武收费站，但不知为何没有取消这两座收费站。
312国道咸阳至永寿一级公路收费经营权在2003年被转让给陕西咸永路业发展有限责任公司，期限为20年。按照陕西省人民政府《关于国道312咸阳至永寿一级公路收费经营权转让的批复》（陕政函【2003】152号），该收费站应于2023年8月31日到期。后因疫情原因，延长到2023年11月 18 日。
在收费超过20年后，这座收费站近日终于正式"退休"。咸阳市交通局于2023年11月17日公告，咸永一级公路收费期限届满，其所属的双照、乾县收费站将于2023年11月18日8时起停止收费。
