其实朱元璋和方孝孺之间也是有故事的，而方孝孺的才华自然也是进入了朱元璋的耳朵里，朱元璋曾经两次召见方孝孺，称他为"异才"，即便如此，朱元璋并没有重用他，原因也很简单，朱元璋治世期间不需要方孝孺这样的人才。
朱元璋在位期间，通过一系列专制政策，比如废除丞相、重用内监、实行特务统治等等，极大地扩大了皇权，形成绝对的君主独裁，而方孝孺和宋濂之间的理念是"仁德治世"，这一点和朱元璋的理念完全不同，因此朱元璋绝对不会重用他，否则影响自己的大刀阔斧，朱元璋曾经也公开的说，把帝国人才留给子孙去用，因此朱元璋执政期间，方孝孺只是一个汉中府的教授，直到1398年朱元璋去世。
朱允炆登基得到重用
朱元璋去世之后，建文帝朱允炆登基，登基之后的第一件事情便是召见了方孝孺，让他做了侍讲学士，虽说这个官职不高，也没有实权，但是有一个好处，那就是能够长期待在皇帝身边，朱允炆但凡读书有疑问，就把方孝孺请来讲解。遇到国事，难以定夺，也会请人去咨询方孝孺。鉴于皇帝的信任和恩遇，方孝孺在建文朝的地位，相当于国师。
