铳规、铳尺和矩度仪的用法都是教学的重点，这些，恰恰正是明朝军队没有的。在这样的训练方法之下，他的军队很快成长为一支在明军中格外突出的新式军队。但是，这支用尽孙元化心血建造起来的精锐，竟然，因为一只鸡而兵变成乱，甚至，直接导致了明清两军势力的倒置。
皇太极于崇祯四年八月，率领清兵大军进攻大凌河城，孙元化得到军情，急忙命令部下的孔有德带领八百尖锐骑兵奔赴前线支援。尽管，部队是奉令北上作战，但是，当时的明朝已是秋后之势，无法保证沿途的军队给养。
北上之路，越发寒冷，及至吴桥时，更是风雪交加，滴水成冰。当地百姓惧兵，不敢与其有太多交集，纷纷关门躲进家中。但是，有一个士兵实在不敌饥寒，就偷了一只鸡。坏就坏在这只鸡不是普通百姓家中的，而属于当地望族王象春的。
于是，王家不依不饶，要孔有德把这个士兵乱箭穿心，并且，抬其游街。军队中皆是为明朝抛头颅洒热血的堂堂军士，自然不能忍受此种侮辱，最终，不可避免地引发了军中大乱。之后，士兵们纷纷拥戴孔有德为帅，发动了著名的"吴桥兵变"。
