最终，在没有办法的情况之下，朱元璋则选择了最坏的办法，也给之后的明朝乃至中国带来了沉重的打击，那就是"闭关锁国"政策。朱元璋明文下令：禁止大明朝的子民再次出海，私自与日本人进行贸易者，处以刑罚... ...可以说，此时的朱元璋，为了隐忍，屎都能吃！
他最终希望，能以此将日本倭患彻底隔绝于海上。
但是，众所周知，海上的财富是无穷无尽的，那些沿海一带的居民没有了这样的天然收入，如何能够保证一家人的吃穿用度。这样长时间统辖下去，人民吃不饱肚子，没有可以御寒的衣物，相信，人心也就慢慢的散了，更别说什么富强民生的笑话了。
而且，中国沿海一代的海岸线很长，尤其是与日本倭寇相通的海岸线，更是长达两万多里。如果，要修整海防，并且，增派海事官兵驻守卫所的话，那么，朝廷所要付出的财力和物力是无穷无尽的。
