高颖没想到，他的那句话传到了独孤皇后的耳中，成了他以后厄运的导火索。独孤皇后以后多次伺机报复、陷害高颖，恶毒地在杨坚面前讲高颖的坏话，使得丈夫终于失去了对高颖的信任而罢官。几年后，高颖被隋炀帝以诽谤朝政罪杀害。当时被杀的还有同样是朝廷栋梁的大将贺若弼等人。所以说是独孤皇后使得大隋江山失去了几个重要的柱石。
第二，她使得杨坚更换了皇位继承人，间接导致了隋朝二世而亡。
史家普遍认为，独孤皇后在废除原来的太子杨勇、改立杨广(日后的隋炀帝)为太子的大事上发挥了关键作用。而独孤皇后"擅自干预朝政"，因此被认为是性格过强、嫉妒心过重的妇人的代表。
原来的太子杨勇年少时，他的母亲独孤皇后为他挑选了一位元氏做妃子，但是元氏很受杨勇冷落，多年不得召见，突发心脏病而死。杨勇宠爱云妃、高妃和成妃等人，并和这几个妇人生下一大堆孩子。对此，独孤皇后非常生气，不断派人伺察自己这个儿子，访探他的举动，还不断在文帝耳边吹风，指摘杨勇的过失。太子杨勇虽然有些好色、奢侈，但为人宽厚，率意任情，没有矫饰假装的性格，常常优礼士人，宽待大臣。
