此时王玄策才意识到原来玛卡达发生里内乱，玛卡达国的国王早已死去，而这位叫阿尔裘那的大臣有心篡位，王玄策因此而卷入了这场阴谋之中，但还在后来王玄策逃出了大牢，他没有选择回国，而是选择去借兵来平定这里的内乱。
这次的内乱规模之大也影响到很多周边国家，对阿尔裘那有怨念的人更是许多，于是王玄策因此而召集了一千多人的军队，之后又来到了泥婆罗，借用松赞干布的名义向泥婆罗国王借用了七千士兵，王玄策再次回到了玛卡达决定向阿尔裘那宣战。
在与王玄策的激战中，阿尔裘那一方损失惨重，最终寡不敌众，王玄策因此平定了玛卡达的内乱，恢复了玛卡达的和平，并将阿尔裘那擒回唐朝。
回到唐朝之后，唐太宗大喜，将他升了官，但立下奇功的王玄策留在史书上的记载却少之又少，有人认为是因为同一时期出使西域的玄奘淹没了他的光芒，但不可否认的是，这位外交官凭一己之力恢复了一个国家的和平，在历史上是空前绝后的。
