卡拉卡尔帕克斯坦进入紧急状态的起因是，卡拉卡尔帕克斯坦首府努库斯市1日爆发了大规模示威游行，抗议乌政府计划取消卡拉卡尔帕克斯坦的自治地位。
6月25日，乌兹别克斯坦公布该国修宪草案，涉及对现行宪法的170多处修订和补充。根据该草案，乌宪法第70条中"卡拉卡尔帕克斯坦主权共和国"的表述，将修改为"卡拉卡尔帕克斯坦共和国"，"卡拉卡尔帕克斯坦共和国的主权受到乌兹别克斯坦保护"的内容被删除；第74条中"卡拉卡尔帕克斯坦在该共和国全民公投通过基础上有权脱离乌兹别克斯坦"的表述被删除。相关修宪内容引起卡拉卡尔帕克斯坦居民不满，认为这将剥夺该地区的广泛自治权，随后卡拉卡尔帕克斯坦的一些公民开始在努库斯市周围进行游行，并在该市中央农贸市场示威。
卡拉卡尔帕克斯坦立法机关、部长会议、内务部在联合声明中指出，努库斯市的"抗议"活动是由一个犯罪集团组织，企图占领卡拉卡尔帕克斯坦的行政机构，从而分裂社会并破坏乌兹别克斯坦的政治稳定。声明还指出，该事件中有"恶意外国势力"的介入，"他们企图影响卡拉卡尔帕克斯坦局势的发展，包括有针对性地发布信息和歪曲事实"。
