嘉靖四十九年（1566年），嘉靖驾崩，其儿子朱载坖即位，为明穆宗，明穆宗在位仅六年，但明穆宗在位期间信用了徐阶、张居正等大臣，废除了海禁，政治上是有所功绩的，隆庆六年（1572年），36岁的明穆宗病逝，10岁的朱翊钧即位，为明神宗，也就是万历皇帝。
原本万历帝与张居正的关系也是非常不错的，要知道张居正其实还是明穆宗和万历帝两人的老师，万历帝5岁被立为皇太子，受到了很严格的教育，也明白自己将来是要当皇帝的，因此有不懂的，还是会主动询问张居正。
一次，10岁的万历帝突然向张居正询问到建文帝朱允炆的事情，也是委婉询问："听说当初建文帝出逃了，是不是真的？"直接点的意思就是"建文帝是我先祖杀的吗？"
