蓝玉是个粗人，没有文化，性情暴躁，刚愎自用。 因为他的战功显赫，又得到皇帝的赏识信任，愈加骄横恣意，做出种种目无法纪的事情。有人就向朱元璋举报蓝玉的一系列违法犯纪的事情：
蓝玉圈养奴仆、广收义子近千人，作为他自己的随从亲信。这些人依仗主人权势，横行乡里，霸占民田。御史接到民众投诉，要依法惩办这些奴仆义子。蓝玉居然藐视王法，把御史赶走。还有一次，蓝玉北征回师，连夜赶到长城喜峰关。此时关门已经紧闭，守关官吏在关城上查明情况，没有及时开门，他竟然纵容士兵毁关闯入。最严重的是，他北征回来，贪污缴获的大量珍宝不算，竟然把元朝的皇妃据为己有，进行奸污。朱元璋获悉此事后勃然大怒：蓝玉如此无礼，怎么配得上大将军的称号？那个皇妃听说皇帝动怒，惊惶自尽。蓝玉上朝时，朱元璋当面严厉斥责，要他今后加强道德修养，痛改前非。朱元璋本来打算进封蓝玉为"梁国公"，鉴于这些劣迹，改为"凉国公"。
更为严重的是，他竟然无视皇帝的威权，恣意骄纵，凭着和皇帝的交情。皇帝召见他时，赐坐交谈或随侍宴饮，他一言一行总是傲慢而粗鲁，一点没有"人臣之礼"。他带兵在外，常常超越权限，擅自决定将校的升降，不向朝廷请示报告。为了显示自己的威权，任意在军士脸上刺字，以此来挟制部下，使军队成为自己的私人武装。西征回来，皇帝赏赐给他"太子太傅"的头衔，其实这个大老粗根本不可能成为太子的老师，只不过是一个荣誉而已。蓝玉居然不识相，大发牢骚：难道我还不配当太子的老师吗？
这就激化了将权与皇权的矛盾，朱元璋这种权力欲望极强的皇帝是绝对不能容忍的。早在洪武六年，朱元璋目睹开国元勋飞扬跋扈，倚功犯法，特地命工部铸造铁榜，写上申戒公侯的条令，警告他们不得倚仗功劳过于放纵。这个禁令已经隐约透露了日后的铲除方针。
