而后清军则是顺势追击，一路上大顺军接连溃败，逃到了湖广一带的九宫山，遭遇清廷英亲王阿济格的追击，全军覆没，李自成仅带领二十几人逃了出去。之后李自成的结局根据清人费密的《荒书》记载：
李万岁爷被乡兵杀死下马，二十八骑无一存者。
李自成被乡勇杀死的说法，也被清朝史官认可，后载于《明史》中。但是当今史学界对此却有很大的分歧，认为李自成没有死，而是出家当了和尚。因为前几年有人根据出土的文物推测出，李自成在湖南石门县夹山寺出家，法号为"奉天玉"。但是这一说法也被人找出几个漏洞加以反驳，所以至今李自成最后结局和下落之谜仍是疑点。
不过李自成的结局已不重要了，他当时死了也好没死也罢，都不会对局势的发展造成影响，而且如今就算他的结局得到揭秘，也仅仅是满足了一些人的好奇心罢了。
