南宋皇帝的陵墓无一例外,均遭到杨琏真迦的毒手。墓内陪葬品被杨琏真迦一伙人洗劫一空。更为残忍的是,杨琏真迦指挥手下将理宗的头颅从尸身上砍下,用作盛放酒水的器具。《南村辍耕录》和《癸辛杂识》都记述了事情的详细经过。
后来,理宗的头颅一直在西藏僧人手中流传。明朝立国以后,太祖朱元璋得知此事,就派人找到了理宗的头颅,于洪武二年(1369年)以帝王礼葬于应天府(江苏南京)。
第二年又命人将理宗的头骨归葬到绍兴永穆陵旧址,将其他五帝的遗骸迁回攒宫,重新归葬。到此,宋朝皇帝们才得以真正的安息。《万历会稽县志》载"诸陵仅存封树,唯孝、理二陵献殿三间,缭以周垣,理宗陵有顶骨碑亭。"
似乎被遗忘的南宋皇陵