1895年1月，威海卫战争打响，萨镇冰被委以重任驻守日岛，这里条件艰苦，萨镇冰的身体也经受不住，曾两次病倒，夫人当时说要来看他，他觉得此地太危险了，于是就派人恢复自己的妻子，让士兵告诉妻子："就说我已经死了，让她速回。"
经过萨镇冰这么努力，不眠不休地指挥战斗，拼死抵抗11天之后，丁汝昌下达了撤退的命令，那时候的他们的军队太弱，甲午战争最终以清军的失败告终，丁汝昌也在2月11日夜晚饮药殉国，作为丁汝昌的部下，萨镇冰被革职，他一度沉浸在悲痛之中，家里也出现了变故，父母和妻子都已经病逝，只剩下两个子女。
直到1896年，萨镇冰才重新任职，重新建立海军之后，萨镇冰付出了更多的心血在里面，大力培养人才，国建面临存亡之秋，萨镇冰夙兴夜寐，不敢懈怠，机会全部的时间都用在工作上面，有时候累了就到书房休息一下。
