由此，侯君集的功业到达了极点。但是谁也没有想到，侯君集破灭二国的壮举，将成为他殒身亡家的开始。
从才能上来说，侯君集是无可挑剔。但从情商上来说，侯君集却有所欠缺，他自幼"性矫饰，好矜夸"且跋扈贪婪。在朝中，侯君集恃才傲物，甚至连李靖、房玄龄都不放在眼里，对于自己官位在他们之下，侯君集总是怒容满面。正是因为侯君集的孤傲，使他与同僚关系变得越来越恶劣。李道宗、李靖等人，曾多次向李世民告状，说侯君集要造反，但李世民却从来不听。
在高昌之战中，侯君集贪婪于高昌国的宝藏，大肆掠夺府库中的珍宝，而上行下效，士兵们也竞相偷盗，造成了极其恶劣的影响。
侯君集领兵回朝后，不仅没有庆功宴、没有喝上庆功酒，反而先吃上了牢饭。如果不是岑文本力保，侯君集恐怕真要被治罪。
