以刘、关、张桃园三结义的特殊关系，对张飞不恭，也就是对刘备不恭。刘备虽然慕贤爱才，但也容不得刘巴如此无礼，自然大为恼火。他愤怒地说："我想定天下，才容纳这种人才，刘巴竟来捣乱，他本来就心在曹营，岂是帮我打天下的。"言语之间，露出了杀机。话一出口，又觉得不妥，就又说："子初才能智慧超过常人。也只有我，可以任用他;换了别人，难以特别地加以委用啊!"但怨恨之意再难消弭。
余生未得重用
一波未平，刘巴却又再次玩火，彻底让刘备对他失去了耐心。公元221年，刘备开始为当皇帝做准备，手下文武官员陆续道贺。刘巴和益州雍茂却不识好歹地劝说刘备："曹丕称帝，中原的人未必服他，他们正要来蜀中投靠大王，兴复汉室，如果你也称帝，他们会失望的。"刘备听了这番话，大倒胃口。他碍于刘巴的名气，宽赦了他。而雍茂就没有那么幸运了，刘备找了个借口把他杀了。一番话决定了刘巴不受信任的命运。从此刘巴再也无法施展其才干，甚至谨慎到"恭默守静，退无私交，非公事不言"。
恃才傲物、自命清高的刘巴，不经意得罪了张飞，起先并不以为然。刘备的态度，终于给了他当头一棒，足以让他胆战心惊。在当权者面前，他不得不收起傲气和清高，夹起尾巴做人。而且一反常态，变得格外谦恭，循规蹈矩，除了起草文件，几乎无所作为。
刘巴在章武二年去世，时年只有三十九岁。总计花了十三年躲刘备，最后八年才认命。死后的他，总算可以摆脱刘备。
