2004 年初，禽流感 ( H5N1 ) 刚刚开始在全球传播。
即便 SARS 灭活疫苗的亏损在当时已成定局，尹卫东仍然坚定认为：" 没有疫苗，一旦禽流感大规模爆发，就会像 SARS 时期一样，所有国家都会对我们封闭大门，我们更不可能期待别国的疫苗支持。"
3 月初，北京科兴联合中国疾病预防控制中心正式开始了人用禽流感疫苗的研发。
直到 2005 年底，当全球关注禽流感疫情，我国也出现人感染高致病性禽流感病例时，科兴宣布已研制成功人用禽流感疫苗，并完成了临床前全部研究工作。
2006 年 6 月，人用禽流感疫苗 I 期临床研究结果揭晓，研究结果显示该疫苗具有良好的安全性和免疫原性。英国的权威医学杂志《柳叶刀》发表了这一科技成果，世界卫生组织全球流感项目负责人 Klaus Stohr 博士也予以评价：" 一个解决大流行流感疫苗制备难题的方法已经被发现，看来他们已经成功了。"
然而在非典后出现的禽流感，虽然使得社会人心惶惶，但感染率极低，全球就 400 多病例，中国仅有 38 例。
北京科兴研发的人用禽流感疫苗再次无用武之地，幸而北京科兴总结出一条相对成熟的技术路线，根据尹卫东介绍：" 假如有一天换了一个非 H5N1 病毒引发大流行，把新毒株填到我们的工艺路线里去，能迅速生产出疫苗。"
事后验证确实如此。
2009 年甲型 H1N1 流感病毒全球爆发，不到半年时间，尹卫东就率领团队研制出全球首个甲型 H1N1 流感疫苗。此后，该项目被人民日报列入改革开放 40 年 · 40 个 " 第一 " 项目。
与此相同的还有 2013 年 H7N9 流感疫苗。
不过，两次研发效益均不乐观，等三期临床试验结束，疫情也已彻底消失。
在几次流行性疾病疫苗的研发上，尹卫东赌上大量研发费用与心血，最后因为疫情消散，丧失继续研制的市场基础，竹篮打水一场空。
而且其在售的疫苗不是国家收储模式，因为定价、运输原因，未能进入国家采购名单。
即便在北京科兴推出了全球首支手足口病疫苗，最被外界看好的 2016 年，科兴仍然在亏损。
其后，尹卫东与潘爱华更是展开股权纷争。2018 年，潘爱华甚至上演了带领二十大汉来到科兴办公室抢夺重要资料的戏码。
2020 年初，新冠疫情爆发，股权纷争终于不了了之，被搁置一旁。尹卫东转身启动名为 " 克冠行动 " 的疫苗研制项目，在政府支持下，再次成为最早一批疫苗国家队成员。
实际上，即便是在 2020 年的年报中，科兴仍然认为：公司产品少，收入来源有限，在售的甲型肝炎疫苗、甲型和乙型肝炎疫苗、流感疫苗等销售收入下降；由于研发费用太高，未来可能亏损。
但新冠疫情的爆发，带给了科兴一次新的上场机会。
从 2020 年那个春天开始，新冠两年，为全世界带来了巨大的变化。对于科兴，这种变化同样巨大。
4 月 30 日，科兴生物（SVA）发布了 2021 年财报，实现总营收 193.75 亿美元，约合人民币 1280.3 亿人民币，净利润 144.6 亿美元，约合人民币 955.41 亿人民币，归母净利润 84.6 亿美元，合 560 亿元人民币。研发支出 1.55 亿美元。在中国大陆，实现销售额 109 亿美元，其他区域销售额 85 亿美元。
作为北京科兴生物开发的新冠肺炎灭活疫苗，CoronaVac（克尔来福）已在 60 多个国家和地区获得紧急使用授权或有条件批准。目前，已有超过 28 亿剂新冠疫苗被运送到世界各地。
与尹卫东从中专生起步的传奇经历相比，今天的科兴，似乎更像一个传奇。
但在鲜亮的业绩背后，却有一系列来自市场的问题，始终与科兴伴随。
为什么它的资本背景始终存在争议，科兴到底是谁的？以至于在中资股东的年报中，出现 " 中外股东之间存在不可调和的矛盾和利益冲突 "。
科兴的第一大股东就是日本的软银集团，其占股 15.07%。第二大的股东才是科兴生物的创始人 CEO 尹卫东。第三大的股东是 CDH 吴尚志等六位创始人，其中占股 8.39%。第四和第五的股东分别是永恩国际和维梧资本，其中占股 8.25%。
很多人因此质疑科兴属于外资企业，利润最终还是都流向国外。
不过，虽然尹卫东没有占到大部分的股份，但他的控制权占了大部分，可以说科兴还是在尹卫东的实际控制下，只可惜最终受益最大的确实是软银集团。
为什么它的利润率如此之高？2021 年，智飞生物净利率 33.30%，康泰生物净利率 34.59%。康希诺净利率 44.35%。在国内控费背景下，科兴生物却独善其身，净利率达到 74.63%。
为什么它的研发投入比例如此之低？2021 年，几大疫苗企业的研发投入占营收比例，智飞生物（代理的默沙东 4/9 价 HPV 疫苗贡献其全部产品货值 80%）为 2.66%。康希诺（销售产品以新冠疫苗为主）为 21.05%。康泰生物、沃森生物分别为 20.22%、21.77%，科兴生物只有 0.8%。
这么多的为什么，和尹卫东的故事结合在一起，变成了一个更大的传奇。
