首先不得不承认，只有在战火的洗礼中，才能真正打造出一支虎狼之师，这是经过无数历史经验反复验证过的事实。所以，绝大多数情况下，一个朝代刚刚建立的时候，其军队战斗力是最为强悍的。清军中后期的战斗力比不上开国时期也属正常现象。
可是，清军在太平天国运动中面临的对手是一群从来没有经历过战争，也没有经过专业军事训练的矿工和农民。清军再差劲，好歹也是专业军人。为什么职业选手反而干不过业余选手呢？这就不能用承平日久、腐化堕落等原因能轻易说得通了。事实上，清军之所以战斗力远不如以前，主要是在军事制度上经过了很大的改变。
康熙皇帝执政后期，为了防止将领出现拥兵自重的情况，就对军队制度作出了这样的改变：佐领以上的清朝军官每隔三至五年就要在各驻地之间调防。这就防止了军官和士兵之间形成长期私人关系，更重要的是杜绝了高级军官和中低级军官之间形成私人关系。对于和平时期来说，这种制度确实可以起到防患于未然的作用。可是到了战争时期，这项制度的缺陷也暴露无遗，因为"兵不习将，将亦彼此不和"。
所以，到了康熙朝后期，清军的战斗力就已经大不如前。青海罗卜藏丹津叛乱，清军费了九牛二虎之力，直到雍正帝即位后，才终于平定。而此前不久，清军曾平定三藩，征服葛尔丹，驱逐沙俄，实力所向披靡。
