此外，还有大量"东突"分子被巴塔培训过。需要说明的是，该组织与阿富汗塔利班虽然名称相同，但并不是一回事，巴塔还经常反对阿塔。
宗教极端组织和其他分离主义组织
在东南部的信德省，北部的巴控克什米尔以及巴基斯坦境内散居分布的印度次大陆移民（穆哈吉尔人）都分别有自己的分离运动，例如信德省解放军（Sindhudesh Liberation Army），巴拉瓦里斯坦运动。而巴境内还有很多宗教极端主义组织，诸如渗透入巴国的伊斯兰国呼罗珊分支等等。
信德省解放军成员
而在这些错综复杂的分离组织和极端组织背后，也少不了幕后大国的操纵。就近来说，巴基斯坦的邻国印度与阿富汗，就屡次被巴方认为是其境内诸多分离组织的推手。
根据巴政府的指责，印度情报部门长期以来充当了俾路支解放军的幕后支持者，该组织的领导人曾多次前往新德里求医，而印度也动用其在阿富汗境内的使领馆，对俾路支解放军提供援助。
阿富汗与巴基斯坦边境线，以及族群分布
而另一邻国阿富汗则更加复杂，1893年，英国殖民者划定了英属印度与阿富汗的边境线杜兰线，让大量的普什图族人跨境分布，形成了巴基斯坦西北部的普什图族聚居区。而杜兰线也造成巴基斯坦和阿富汗的关系一直处于较为紧张的状态。去年底今年初，两国还在边境线一带发生交火。值得一提的是，巴基斯坦早期的领导人阿尤布·汗，前总理伊姆兰·汗，均有普什图血统。
再追根溯源来看，其实造成南亚次大陆当前很多分离主义问题的原因，都是当年的殖民统治者所留下的，诸如杜兰线，以及克什米尔归属等问题，使得巴、阿、印三国彼此心存芥蒂，对于各自的分离主义势力互相资助。
而随着后来苏联入侵阿富汗，当时的美国政府对于所谓"圣战者"的资助，客观上也让这一地区涌入了大量武装分子和极端主义思潮：俾路支分离运动最早的组织者，有着克格勃背景，而臭名昭著的"基地"组织更是在苏联入侵阿富汗期间，被美国中情局"发扬光大"。
苏联入侵阿富汗期间的所谓"圣战者"
而对于中国公民和中巴经济走廊项目来说，这些分离主义和极端主义组织造成的恐袭确实是一个严重的威胁。不过巴基斯坦政府对于这些组织的打击也是毫不手软。2018年，一向被视为"法外之地"的联邦直辖部落地区和开伯尔-普什图赫瓦省合并，迈出了巴政府实行政治整合的重要一步，而中巴经济走廊建设，立足于基础设施的操作，也为巴民众带来了切切实实的利益与实惠，得到了巴国不同政治派别的一致支持。从这个角度来看，中巴之间的合作大势是不可阻挡的。
