等到了崇祯十五年的时候，天津也爆发了鼠疫，病人得了鼠疫有的最后吐血而死。等又过了一年的时候变成了肺鼠疫，得肺病而死得人更多，传染性更为强烈。京城有的老百姓的家中甚至都已经死绝户了。
来到京城的这场鼠疫，一共持续了整整一年半多，在这期间北京城每天死亡得人数已经上万了，甚至要掩埋尸体都买不到棺材，找不到地方。尤其是沿街住得老百姓染病得概率十之八九，有的甚至惨死街头。曾有数据显示这场瘟疫带走了至少二十万得老百姓，而当时得京城不过百十来万，也就是说每五个人里边可能会有一到两个人因病而死。不仅仅是士兵得病，最后连叫花子都看不到了。
这种现象直到一个福建人的出现才暂时得到了缓解，他偶然间发现了鼠疫的治疗手段，就是用刺血法来给病人治病，每天光是排队的人就有成千上万。等到崇祯16年的冬季时，京城的的老鼠和人死的也差不多了，鼠疫才得到了初步得控制。
根据史学家得统计，明朝末年全国的总人口大约在一亿人左右，而在崇祯和万历两次鼠疫过程中就造成了千万人得死亡，这在人类的抗疫史上也属于最严重的几次。虽然明朝的灭亡原因有很多，但不得不承认鼠疫所导致的灾祸进一步加快其灭亡。
