徐有贞却说："不杀于谦，此举无名"。翻译成白话就是：如果不杀掉于谦，我们夺门之变就没有正当的名义。
朱祁镇于是下令把于谦在闹市处死并弃尸街头，抄了他的家，家人都被充军边疆。
于谦虽然官至兵部尚书，但生活过得清贫如洗，抄家的时候，家里没有多余的钱财，只有正屋关锁得严严实实。打开来看，都是皇上赐给的蟒袍、剑器，在场的锦衣卫无不黯然落泪。
于谦死的那天，阴云密布，全国的人都认为他是冤枉的。一有个叫朵儿的指挥，本来出自曹吉祥的部下，他把酒泼在于谦死的地方，恸哭。曹吉祥发怒，鞭打他。第二天，他还是照样泼酒在地表示祭奠。都督同知陈逢被于谦的忠义感动，收敛了他的尸体。
补一句，于谦还是一位好丈夫，他在妻子过世之后，从此不再娶妻纳妾，可见他对妻子感情的专一和真挚。
