对于明朝的灭亡，身处那个时期的崇祯皇帝后世对他的评价是褒贬不一，对于崇祯的争议，最主要的还是在于用人层面，面对内忧外患，崇祯皇帝可以说是求贤若渴，对于将帅之才更是看得很重。在所有的明末将领中，孙传庭这个人虽然不是武将出身，但颇具才干和谋略；由此得到了崇祯的信任，并授予他兵权，让他执行剿灭农民军的任务。
孙传庭果然不负崇祯的厚望，在崇祯九年与农民军领袖高迎祥的战斗中表现十分出色。当时，高迎祥复出，很快占据了四川、河南两省与陕西交汇的地方。孙传庭猜到高迎祥必然要向陕西进攻，于是采用诱敌深入的计策，高迎祥中计后，意欲从子午谷口突围，但孙传庭已经在子午谷的黑水峪做好了埋伏，这一战，孙传庭将农民军全歼，高迎祥也被生擒。之后，孙传庭还多次挫败农民军起义，甚至将闯王李自成杀得全军覆没。
可惜的是，这么一位将才最终也遭到了崇祯的猜忌，崇祯十一年，多尔衮率清军绕过山海关，假道蒙古，直逼北京城。危急时刻，崇祯急调陕西总督孙传庭和天雄军总督卢象升回师勤王。卢象升在这一战中阵亡，当孙传庭达到京师附近时，多尔衮却选择了退军。
