公元316年八月，匈奴人刘曜建立的前赵政权南下进攻长安，将长安城团团围住，切断了城内与外界的一切联系。十一月，城内粮尽，无法拒守。晋愍帝只能赤露肩背，口含玉壁，乘坐羊车，出城向刘曜军队投降。六日后，刘曜军队将晋愍帝君臣一行人等押往前汉都城平阳，西晋至此正式灭亡。
随后，晋愍帝司马邺被废，改封为怀安侯、光禄大夫。在他生命中的最后两年，一直遭受刘聪的百般羞辱。出猎时，命令他全身披挂，手执长戟，作为前导。刘聪宴请群臣时，命令司马邺穿上青衣，做斟酒、洗怀的杂役工作，甚至服侍自己如厕。刘聪怕晋人复仇建国之心不死，于是在公元318年二月，派人杀死了愍帝司马邺，年仅十八岁。
