第四次入关发生在崇德三年（1638年），这次皇太极虽然没有亲征，却提兵压到宁锦，目的是为了配合入关主帅多尔衮，让明朝不敢调关外兵回防。
这次入关，明朝损失更加巨大。密云总督吴阿衡战死，督师卢象升殉国，济南一天被攻破，德王朱由枢等众多宗室被擒，清军连胜57阵，掠获人畜财物不计其数。
崇祯震怒，事后清算一次性处死了几十位官员。更为重要的影响在西北，孙传庭和洪承畴联手，本来已打得李自成几乎全军覆没，只剩18骑逃入商洛山中。由于清军入关京师吃紧，崇祯急调洪、孙二人回京帮助防御，给了李自成喘息的机会，埋下他东山再起的隐患。
第五次进关也是皇太极时期最后一次。崇德七年（1642年），刚刚在松锦之战取胜的皇太极丝毫不给明朝喘息的机会，派阿巴泰领军由界岭口和黄崖口入关。
这是五次入关中时间最长的一次，长达八个月，清军甚至在中间还从容地休整了一个月，如入无人之境，就像在自己家中一样。
