当黄巢再次坐上皇位时，在长安城又开始了疯狂的屠杀行为，经过这次大屠杀，长安城内的男性几乎被诛杀殆尽，长安城血流成河，"贼怒坊市百姓迎王师，乃下令洗城，丈夫丁壮，杀戮殆尽，流血成渠。"
黄巢残暴已成为事实，但黄巢却做了一件颇有意义的事情，就是铲除了一个毒瘤，消灭了门阀士族。门阀士族以门第为标准，是在当时社会中占有特殊地位的特权阶层。无论是政治上，还是经济上，门阀士族都有了崇高地位。
门阀士族垄断仕途，控制国家中枢，兼并土地等，一切都处于特权地位。门阀士族始于东汉末年，最大的特点就是逐渐把持朝政面，尤其是"九品中正制"这一选官制度的盛行，更加剧了门阀士族的发展。
