后来的日子更加难过，李茂贞勾结宦官将朝中正直的大臣一一剪除，于乾宁二年，杀死宰相崔绍纬，再度挥师长安，昭宗被迫逃离，向李克用求助，路上被李茂贞的追兵追上，挟持到华州，幽静了三年之久，这三年昭宗每天活在恐惧中，心理受到了巨大的创伤，昔日的一腔热血也荡然无存。
乾宁五年，昭宗终于被放回了长安，但是此时大唐王朝已经名存实亡，长安的宦官们看着狼狈的皇帝，心中再次做起了操控国柄的大梦，在宦官头子，神策军中尉刘季述的带领下，宦官们趁昭宗沉睡之际，率领禁卫士兵一千多人，发动了宫廷政变，尊奉小太子继承帝位。神策军将朝堂封锁，逼迫大臣们同意太子监国，大臣们在刀剑威逼下只得违心的同意。
可怜的昭宗和皇后被宦官们囚禁在少阳院。为了防止唐昭宗给外边通风报信，刘季述下令一支笔、一张纸也不准送进去。为了防止意外，任何金屑器具，如兵器、针、刀等，一律不准送入，昭宗和皇后每天的饮食由宦官通过墙洞塞进去，堂堂一国之君沦落至此，着实可悲。
