在改革朝政方面，朱由检最大的动作便是瓦解阉党。然而，正如前文所说，他虽然看到了阉党和党争的危害，但却并未仔细考虑阉党存在的价值，结果虽然将阉党彻底铲除，全面削弱厂卫职权，然而不仅没有消灭党争，反而使得文官在失去监察之后更加为所欲为。我们以浙江的茶税为例，天启年间时尚有二十余万两，而在茶监撤销之后，到崇祯十年（1637年）时，竟然下降到了每年十二两白银。
李自成
而在财政改革方面，作为以农业税为主的国家，由于明末时期土地兼并极为严重，占有大量土地的官僚阶级却可以用各种方式合理避税，在工商杂税无法支撑收入的情况，所谓的"开源"反而是将压力压在了普通百姓身上，导致百姓怨声载道。而在"节流"方面，各级官员为了避免自身利益遭到损失，却将基层"公务员"作为了节流主要群体，结果导致他们被大量裁撤，例如李自成本是吏员，收入本就微薄，被裁撤之后，走投无路的他只能杀了债主，最终变成乱民，且对朝廷怀恨在心。
由于当时朝中文官集团势力太过庞大，朱由检的改革最终误入歧途，不仅没能使得朝廷局面好转，反而加剧了天下的动荡。
综上所述，严格来说朱由检并不算是一位昏君，而只是一位才能较为平庸的君主，可他偏偏又太过勤勉，结果不仅无法扭转局势，反而加速了明朝的灭亡。这是朱由检的悲哀，同样也是明朝的悲哀。
