第一次北伐，朱元璋派遣大将徐达率大军穿越漠南，进入漠北与元军作战。朱元璋多次写信招降，元将扩廓帖木儿不予理会，与明军形成对峙。
明军与北元军在辽南对峙多年后，傅友德、蓝玉等发起第五次北伐，经过多次交战，1387年，北元守军投降蓝玉，明朝占领东北地区。
1381年，明军攻入云南，镇守云南的元朝梁王自杀，明军随后攻克大理，陆续平定云南地区。
为彻底荡除北元势力，1388年，朱元璋命蓝玉率15万大军发动第六次北伐。蓝玉大军横跨戈壁至捕鱼儿海击溃元军，俘虏8万余人，北元至此国势大衰，不再使用年号。
百年前，蒙古人在崖山对南宋赶尽杀绝，如今自己也被赶出了占领地，老老实实回到北方草原的老家。此后，"大蒙古国"再也不曾复活。
