"巡抚"的情况又有不同，没有兼职的"巡抚"只负责一省行政事务，品秩为"从二品"，相当于正部级的省委书记。
但在不设"总督"的省份，"巡抚"一般会兼任"提督衔"，成为手握一省军政大权的最高长官，除了管辖范围不同外，几乎和"总督"没有任何差别。
和"总督"一样，"巡抚"也可以通过"加衔制"来享受高配待遇。一般情况而言，"巡抚"可加之"兵部侍郎衔"或者"副都御史衔"，品秩从"从二品"升级为"正二品"，行政级别从正部级升级为副国级。享受"加衔制"以后的"巡抚"，基本相当于兼任国防部副部长或者中纪委副书记、国务委员的省委书记。就此来看，"提督"也应该在"巡抚"之下。
就行政级别和具体职权来看，"总督"应该排在"巡抚"之上，但实际上，两者之间并无明确统属关系，而是相互监督、相互制约的特殊关系，都是直接对皇帝负责，直接听命于皇帝。细分下来，"总督"更侧重于军事方面的领导，而"巡抚"更侧重于民事方面的领导，至于交叉事务或者省内其他事务，要么听皇帝的最高指示，要么坐下来商量出一个办法，请示皇帝批准后施行。
