洪武十五年的五月，朱标的大儿子朱雄英死去，当时只有八岁。
朱元璋死后，皇太孙朱允炆登基，就是建文帝，他下令把祖父朱元璋和外祖父吕本的灵位都供奉在西宫之中，四时祭祀。他又尊自己的父亲朱标为孝康皇帝，庙号为兴宗，尊母亲吕氏为皇太后。
燕王朱棣在北平起事，率军南下，几年的厮杀之后，燕军打到了南京。打下金川门时，朱棣把吕太后迎接到军营当中，以礼相待，称她为皇嫂，并向她解释自己起兵，是不得已而为之。
吕太后再次回城时，皇宫之中已经燃起了大火。一般认为，建文帝朱允炆和皇后一起葬身于火海之中。但也有传言认为，朱允炆趁乱逃出南京，潜藏民间，不知所终。
