事发之后，王著等人被诛杀剁成肉酱，但他们显然是为民除害了。
阿合马一死，许多投鼠忌器的大臣开始跟忽必烈细数阿合马的罪行，忽必烈马上派人查抄阿合马的家。搜出了金银财宝和美女还不算，忽必烈还搜出了两张完整人皮，当时两张人皮放在一个小妾的柜子里保存完好，还有一个阉人在看管。
忽必烈询问这人皮有何作用，阉人回答：这是阿合马用来诅咒别人的物品，要是想诅咒谁，只要把人皮放在一个法座上面就可以灵验。此时就有人趁机说：阿合马这几张人皮是针对忽必烈使用的，他肯定有谋反的嫌疑。
饶是忽必烈脾气再好，此时也是大怒，他下令掘墓开棺，把阿合马的尸体进行车裂，随后再扔到大街上喂狗。同时阿合马的几个当上官的子侄辈也被诛杀，他的四个近身侍卫也被处以剥皮的极刑。
阿合马的一生可以说从风光到极度悲剧，他也算是一个能臣。可贪婪让他做出了各种享乐行为，最后被诛杀也是咎由自取，本来他对元朝的贡献还是很大的，就是因为作恶多端所以才落到这种下场，后来还被人列为元朝第一奸臣，也是活该至极了。
