这个时候，刘玄又下了一招臭棋，他竟然不死守长安以待勤王，却派出丞相李松率军出城主动迎击赤眉，结果李松理所当然的当了败虏。守城的城门校尉李汎正是李松之弟，他听说哥哥落于敌手，害怕他有个闪失，竟然打开城门投降了。
九月，绿林赤眉攻破长安，不肯当王莽的刘玄又仓皇逃走，向北逃窜。更始群臣则全部投降了建世政权，反正两个朝廷都姓刘，都称汉，没啥区别。刘玄众叛亲离，逃到高陵后便被部下软禁，以为奇货可居。
一个月的功夫，两边互换地方，这就是更始帝的末路。建武帝刘秀听说了自己老上司的悲惨遭遇，于是下了一道诏书，说：
更始破败，弃城逃走，妻子裸袒，流沉道路。朕甚愍之。今封更始为淮阳王。吏人敢有贼害者，罪同大逆。
这道诏书下的很有意思：赤眉军自己也立了皇帝，和你刘秀平级，怎么可能听你的不去加害刘玄呢？而且，刘玄是刘秀的杀兄仇人，刘秀却不让人害他，我咋就不信呢？
