南宋灭亡之后，“诸文武臣流离海外，或仕占城，或婿交趾，或别流远国”。“除左垂相陈宜中走占城外，尚有吏部尚书陈仲微、参知政事兼广西宣谕使曾渊子等，这些南宋移民不忘故国，颇有与南洋诸国联结谋兴复的图谋”。因此在面对内有叛乱，外有联结图谋的形势下，忽必烈为了防止南宋遗民借助南洋诸国的兵力“复宋”意图，通过对内征兵，对外征伐的策略，消耗南宋遗民的反抗力量，打击海外支援势力，来实现其统治的稳定性。至元二十二(1285)年对安南的征伐中，元军就“于安演州、清化、长安、获亡宋陈尚书婿、交趾梁奉御及赵孟信、叶郎将等四百余人”。因此，防止南宋残余势力的兴起，也是忽必烈所发动战争的原因之一。
日本是回绝元朝最坚决的国家，多次遣使或遇杀戮或遭驱逐，因而最早遭到忽必烈的用兵。至元十一年(1274)三月，在南宋还没有被灭掉之前，忽必烈“遣木速塔八、撒木合持招使高丽签军五千六百人助征日本”。同月，“命凤州经略使忻都、高丽军民总管洪茶丘，以千料舟。拨都鲁轻疾舟、涉水小舟各三百，共九百艘，载士卒一万五千，期以七月征日本”。
