六月初四一大早，李世民带人在玄武门内埋伏好，请君入瓮。果然，不一会，二李就进了玄武门，快到临湖殿的时候，李建成嗅到了危险，于是和李元吉调转马头往回走，这时候李世民出现了。李世民一箭射去，李建成应声倒地，尉迟敬德带领七十骑赶来，结果了李元吉。期间李世民的马惊走，将李世民带进树林，差点为李元吉所伤，幸有尉迟敬德赶到一箭射死了李元吉。
就在二李都被解决了的时候，东宫和齐王府的侍卫府兵已经知道二李遇到了危险，薛万彻、谢叔方、冯立等人火速集结2000兵力直奔玄武门而来，只是玄武门早已关闭，张公谨奉命领700余人在玄武门外严阵以待，双方激战。当时掌宿卫屯兵玄武门的云麾将军敬君弘不顾身边人的劝阻而挺身出战，与中郎将吕世衡双双被杀。战况异常激烈，薛万彻甚至扬言再不打开玄武门就去攻打秦王府。
就在这个时候，尉迟敬德提着二李的人头让玄武门外混战的众人看，告知大家二李已死，继续打下去是没有什么好结果的。冯立一看，对自己的部下说:"我已经杀了敬君弘，也算是报答太子的知遇之恩了。"然后就地解散，自己逃到了荒郊野外。薛万彻也带着数十人跑到了终南山躲了起来。剩下的部分兵力已经对李世民构不成威胁。
另一边，李渊带着陈叔达、萧瑀、封德彝等人在游湖，正等着李建成、李世民和李元吉前来，把事情掰扯来。结果几人等来的是全副武装的尉迟敬德，尉迟敬德告知李渊二李试图谋反已被李世民杀死。然后请求李渊让李世民全权处理玄武门的叛军。李渊略一沉思就知道了目前的境况，于是下旨让李世民处理叛军。圣旨一到，叛军自然无话可说。
李世民赢得了最终的胜利。李世民将自己的十个侄子全部杀死，东宫和齐王府的女眷被囚禁宫中。本来李世民还要杀死李建成和李元吉的心腹谋臣武将，尉迟敬德再三劝阻李世民：现在正是收买人心的时候，万不可大开杀戒，让世人心寒。所以后来的魏征、王珪、薛万彻等人才有机会入朝为官。
