当李渊等叛逆官员为天下而战时，如果没有秦琼在战场上的努力，李渊很难如此迅速地击败旧隋等叛逆官员的势力，从而建立唐朝。之后，李渊让二儿子李世民带着秦琼等瓦岗英雄到战场上作战。秦琼、程咬金、尉迟恭战无不胜。当敌人看到唐军的司令官是他们三人时，战斗的士气顿时低落。秦琼一般以统帅统率全军，程咬金为先锋，一招三斧吓唬敌人。如果程咬金在与敌将作战时处于不利地位，玉池功会发挥作用帮助他。
但唐太宗建立后，秦琼的便衣病了12年，再也没有出现在战场上，甚至在家里。全世界都不知道发生了什么，就连唐太宗也不知道发生了什么。有一次他问自己，他只是回答说没关系，只是多年战争留下的一种隐疾。唐太宗一听到这句话，就不再强求他，亲自派人到他家里为他送上上等的药草到皇宫，但秦琼从来不喝，叫仆人倒出来，这可能是一种很强的预防意识，也可能只是一种没有好药能治好的病。可以说，唐太宗对他很好。他在二十四人中为他订了一张桌子，他捐款后的报酬从不含糊。秦琼为什么变成这样？
