不仅如此，朱元璋大肆诛杀功臣是在胡惟庸案之后。胡惟庸案开始于洪武十三年（1380年），而刘伯温死的时候是洪武八年（1375年），中间隔了好长一段时间。由此可见，朱元璋诛杀功臣宿将是在刘伯温死后五六年之后的事了。当时，刘伯温并没有处在那样的政治风气当中，朱元璋谋害他的可能性不大。
既然朱元璋没有密谋杀害刘伯温的必要，自然也就没有所谓的马皇后妙计救刘伯温的事了。马皇后妙计救刘伯温，很可能只是民间传说。这些传说体现了人们对她仁慈宽厚的认可。
关于刘伯温的死有说法称，他是明初派系斗争的结果。明朝建立后，朝廷内部大臣以地域分成两派，开始了新的争斗。一派是以李善长为代表的淮西派，这一派人多势众，主要成员有李善长、郭兴、郭英、汤和、周德兴等人。另一派是以刘基、杨宪为代表的浙东派。当初，刘伯温处死了李善长的亲信李彬，结怨于李善长。后来，李善长推荐的胡惟庸上台，成为淮西派新的代表，深受朱元璋的宠信。至此淮西派对浙东派形成压倒性优势，据说胡惟庸借探望刘伯温的名义送药给他，下毒害死了他。当然这只是一种说法，不一定是历史真相。
