不过崇祯皇帝并非本文探讨的主要对象，除崇祯皇帝之外，还有一个我们十分熟悉的历史人物应该为南明短命负责，这个人就是大名鼎鼎的民族英雄史可法。在北京政权覆亡之后，一直作为备份的南京朝廷开始发挥作用，而此时史可法是南京兵部尚书，是南京政权的最高长官，他的决定将会影响南明的历史走向。然而，史可法接手最高权力之后的第一件事情就搞砸了。
崇祯皇帝死后，按照伦序应当由万历皇帝的孙子、崇祯皇帝的堂兄、福王朱由崧继位，但是东林党人却不同意，他们觉得朱由崧是个昏聩之人，不适合继承皇位，其实他们背后另有原因——东林党人在万历年间，曾经反对朱由崧的父亲、老福王朱常洵争立太子，由此结下了梁子，如今福王一系要继承皇位，东林党人害怕福王登基后会报复东林党人，于是他们提出选万历皇帝的侄子、潞王朱常淓为新皇帝。史可法作为东林党人，自然不能反对，但是从伦理出发，他又觉得应该立万历皇帝的子孙，而不是侄子。于是，史可法和凤阳总督马士英讨论出了一个折中方案——选万历皇帝的另一个儿子、桂王朱常瀛为新的皇帝。
但是，史可法却低估了福王朱由崧的能力，虽然朱由崧从小生长着藩王府中，也并非什么雄才大略之人，但是面对从天而降的皇位，他还是心动了，而且也行动了。朱由崧通过太监联系到了当时手握兵权的高杰、黄得功和刘良佐等江北三镇军阀，而马士英也迅速倒戈，表示支持福王，最终在武力的支持下，朱由崧到南京登基称帝，史称弘光皇帝。
虽然弘光皇帝登基后没有追究史可法，让史可法入阁办事，但是史可法已经失去了自己的地位，最终被首辅马士英排挤出朝廷，“自愿”到江北守扬州了。史可法给南明带来了两个不好的基因：第一，藩王争立，史可法和东林党人模糊了继位的顺序，放弃“血缘亲疏”这个唯一且明确的判断标准，而采用“贤能”这个模糊的标准，导致日后南明藩王争立的局面，使得抗清力量分散，不能形成合力。第二，军阀干政，由于史可法在拥立福王问题上的摇摆，导致福王寻求军阀的帮助，使得军阀势力得以渗透到朝廷之上，并且在一定程度上控制了朝政，形成了军阀尾大不掉、各自为战的局面，这是南明败亡的一个重要原因。
虽然，将南明短命的原因都归咎于史可法是不恰当的，但是南明与南宋差距如此之大，史可法难辞其咎。
参考文献：《南明史》
