而卫拉特联盟早就归顺清军，从这一点来说，准噶尔部夺取了卫拉特盟主之位，进而组建成准噶尔汗国也就是对清廷的背叛。
准噶尔汗国的大汗葛尔丹，通过东征西讨奠定了准噶尔汗国的基础，有人将葛尔丹与康熙、彼得大帝称为东亚三大帝，可见准噶尔汗国的实力，葛尔丹很有野心，一度想要入主中原取代清廷。
准噶尔汗国巅峰时期，控制的领土一度超过七百万平方公里，跟清朝的领土面积不相上下，对于崛起中的准噶尔汗国，清廷十分重视，也积极警惕。
但是当时清廷内部不稳，既有三藩叛乱，又要收复台湾，还要抗击沙俄，事情太多，再准噶尔的再三挑衅下，康熙也未敢轻易开战，直到内部问题都解决之后，并且与沙俄签订了条约后，才腾出手来对抗准噶尔。
