清朝入关后实行了休养生息的缓和矛盾政策，相对富庶的生活造就国泰民安的局势就不会发生民众伪装倭寇参与掠夺
而清朝虽然也闭关锁国，但是在乾隆之前还是保留了四个通商口岸（当乾隆时期才只留下了广州一地）。况且满清为了稳固自己的统治，在入关后也实行了缓和阶级矛盾和社会矛盾的休养生息政策。随着高产作物的传入且国泰民安，清朝的人口迅速增长。所以清朝中前期老百姓的日子还过得去，相对安逸的日子老百姓自然不会为了生计伪装海盗进行劫掠。
清朝为收复台湾准备了精锐水师，况且台湾纳入版图后倭寇再想劫掠东南沿海或者南洋困难重重；况且西方殖民者已经拓展至东南亚，倭寇原始劫掠也没有了机会
