天京陷落后，幼天王洪天贵福和忠王李秀成先后被俘，洪天贵福年仅15岁，一样被处以凌迟之刑，相对来说，李秀成的下场就稍好些了，至少相对于其他被俘的太平军将领来说。
李秀成在曾国藩营中，一边写下数万字的自述，追述自己的经历和太平天国的兴亡得失，另一边劝说曾国藩反清自立。曾国藩虽对李秀成起了惺惺相惜之情，但也表示自己绝不会做反臣。
当时清廷下旨，命曾国藩将李秀成押往北京公审，然后凌迟处死，就像当年的李开芳、林凤祥一样，但曾国藩最终却没这么做。
1864年8月7日，曾国藩特意派幕僚李鸿裔面见李秀成，向他通报"国法难逭，不能开脱"，并说将于当天将他处死。李秀成听后谈笑自若，对李鸿裔说："中堂厚德，铭刻不忘。今世已误，来生图报！"留下十句绝命诗后被斩首，成为被俘太平军将领中唯一一个没有被凌迟处死的人。
事后，曾国藩将李秀成尸体装入棺材，葬于南京。
