于是，魏忠贤紧急找到崇祯皇帝身边的老太监徐应元，请求他代为向崇祯求情，并假装要告罪辞职。
没想到的是，崇祯却顺水推舟，批准了魏忠贤辞职，并迅速任命自己的手下控制了东厂、锦衣卫以及京城中的巡防等要职，并将兵部尚书崔呈秀等魏忠贤的党羽逮捕下狱，罢免阉党势力的工部尚书吴淳夫等人官职，由此迅速掌握了朝中大权。
天启七年（1627年，朱由检到1628年才改年号为崇祯），农历十一月初一日，仅仅登基才2个来月的崇祯皇帝下发诏书称：
朕览诸臣屡列逆恶魏忠贤罪状，俱已洞悉·····忠贤不报国酬遇，专逞私植党，盗弄国柄，擅作威福，难以枚举····本当寸磔（凌迟处死），念梓宫（熹宗皇帝灵柩）在殡，姑置凤阳····家产，籍没入宫。其冒滥宗戚（党羽），俱烟瘴永戍（贬戍）。
